Bobcat 339 est un nouvel inhibiteur de l'enzyme TET à base de cytosine, doté d'une bonne sélectivité. Il présente des valeurs d' IC50 de 33μM pour TET1 et de 73μM pour TET2, et n'inhibe pas l'ADN méthyltransférase DNMT3a[1]. Les enzymes TET sont des modulateurs épigénétiques clés qui facilitent la déméthylation de l'ADN et régulent la différentiation et le développement cellulaires[2]. En inhibant de manière compétitive l'oxidation de 5-méthylcytosine (5mC) médiée par TET, Bobcat 339 est particulièrement adapté à l'étude des fonctions de TET dans la recherche épigénétique et à l'élucidation des mécanismes dans des modèles de maladies pertinents[3,4].
In vitro, le traitement des cellules neuronales hippocampiques de souris HT-22 avec 10μM de Bobcat 339 (dans DMSO 1%) pendant 24h a significativement réduit les niveaux globaux de 5-hydroxyméthylcytosine (5hmC)[1]. L'incubation des cellules neuronales hypothalamiques de souris GT1-7 avec 10μM de Bobcat 339 pendant 6h a diminué l'expression de la protéine TET3 sans affecter l'abondance de son ARNm[5]. De plus, un traitement de 72h des cellules de cancer deu sein humain MDA-MB-231 avec 5μM de Bobcat 339 a downrégulé l'expression du gène FANCA et a significativement inhibé la prolifération cellulaire via l'inhibition de TET [6].
In vivo, l'injection intrapéritonéal de Bobcat 339 (2.5mg/kg) chez des souris exprimant spécifiquement la GFP dans les neurones à peptide apparenté à l'agouti (AgRP) de l'hypothalamus a entraîné une réduction notable des neurones AgRP positifs pour TET3 en moins de 2 jours, accompagnée d'une activation neuronale accrue (indiquée par une élevée de la protéine FOS)[5]. Chez des souris C57BL/6 soumises à une occlusion transitoire de l'artère cérébrale moyenne (tMCAO) et à un état hyperinflammatoire induit par lipopolysarccharide (LPS) (10mg/kg; voie i.p.), l'administration intraveineuse de Bobcat 339 (10mg/kg/jour) pendant 3 jours consecutifs a significativement réduit le volume de l'infarctus cérébral et a amélioré la récupération fonctionnelle neurologique[7].
References:
[1] CHUA G N L, WASSARMAN K L, SUN H, et al. Cytosine-based TET enzyme inhibitors[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2019, 10(2): 180-185.
[2] WEIRATH N A, HURBEN A K, CHAO C, et al. Small molecule inhibitors of TET dioxygenases: Bobcat339 activity is mediated by contaminating copper (II)[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2022, 13(5): 792-798.
[3] FENG J, SHAO N, SZULWACH K E, et al. Role of Tet1 and 5-hydroxymethylcytosine in cocaine action[J]. Nature Neuroscience, 2015, 18(4): 536-544.
[4] XU Y, YANG Y, WANG Z, et al. ZNF397 deficiency triggers TET2-driven lineage plasticity and AR-targeted therapy resistance in prostate cancer[J]. Cancer Discovery, 2024, 14(8): 1496-1521.
[5] LV H, CATARINO J, LI D, et al. A small-molecule degrader of TET3 as treatment for anorexia nervosa in an animal model[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2023, 120(16): e2300015120.
[6] LUO L, YUAN F, PALOVCAK A, et al. Oncogenic properties of wild-type DNA repair gene FANCA in breast cancer[J]. Cell Reports, 2025, 44(4): 115480.
[7] WANG Y, ZHANG L, LYU T, et al. Association of DNA methylation/demethylation with the functional outcome of stroke in a hyperinflammatory state[J]. Neural Regeneration Research, 2024, 19(10): 2229-2239.