IF 21
PMID: 38671262 ↗Palmitic Acid Alkyne
Catalog No.: GC40292Purity:>99.50%Synonyms: Alk-14
Palmitic Acid Alkyne은 ω-말단 알킨을 가진 팔미틱산이고 아지드 기를 포함하는 분자에 대한 알킬 사슬 기반 PROTAC 링커로 작용하는 클릭 화학 시약이다.
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Cas No.: 99208-90-9
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인용 문헌 (Citations)
1 publications이 제품을 사용한 연구자들의 논문제품 설명 (Description)
Palmitic Acid Alkyne은 ω-말단 알킨을 가진 팔미틱산이고 아지드 기를 포함하는 분자에 대한 알킬 사슬 기반 PROTAC 링커로 작용하는 클릭 화학 시약이다. Palmitic Acid Alkyne은 단백질 검출, 공액 교통 결합, 영상 보조 벡터 및 PROTAC 링커 등에 적용된다[2,3,4,5].
References:
[1] Honcharenko, Dmytro et al. “New Alkyne and Amine Linkers for Versatile Multiple Conjugation of Oligonucleotides.” *ACS omega* vol. 6,1 579-593. 18 Dec. 2020, doi:10.1021/acsomega.0c05075
[2] Yap, Megan C et al. “Rapid and selective detection of fatty acylated proteins using omega-alkynyl-fatty acids and click chemistry.” *Journal of lipid research* vol. 51,6 (2010): 1566-80. doi:10.1194/jlr.D002790
[3] García-Cazorla, Yolanda et al. “Conjugation inhibitors compete with palmitic acid for binding to the conjugative traffic ATPase TrwD, providing a mechanism to inhibit bacterial conjugation.” *The Journal of biological chemistry* vol. 293,43 (2018): 16923-16930. doi:10.1074/jbc.RA118.004716
[4] Paiva, Eduardo M, and Florian M Schmidt. “Ultrafast Widefield Mid-Infrared Photothermal Heterodyne Imaging.” *Analytical chemistry* vol. 94,41 (2022): 14242-14250. doi:10.1021/acs.analchem.2c02548
[5] Gao, Xinxin, and Rami N Hannoush. “A Decade of Click Chemistry in Protein Palmitoylation: Impact on Discovery and New Biology.” *Cell chemical biology*vol. 25,3 (2018): 236-246. doi:10.1016/j.chembiol.2017.12.002
실험 프로토콜 (Protocol)
클릭 팔미틸화 측정
1.HEK293T 세포를 배양하고 YKT6-WT BioID, YKT6-3E BioID 및 Wnt3A를 함유하는 플라스미드로 10% FBS가 보충된 DMEM에서 세포를 전염합니다.
2. ω-Alkynyl palmitic acid (Palmitic Acid Alkyne)을 에탄올에 녹고 최종 농도를 50 mM으로 하고 -80°C에서 보관합니다.
3.Palmitic Acid Alkyne을 최종 농도 100㎍/㎖로 희석하고 5% FBS(지방산frei)가 보충된 DMEM에서 실온에서 15분 동안 수조에서 초음파 처리한 후 다시 15분 동안 처리전 복합화를 허용합니다.
4. Palmitic Acid Alkyne을 함유한 배양액을 추가하고 24시간 후 부분적으로 교체합니다.
5.전염 후 72시간에 세포를 가수분해(PBS에 1% Triton X-100, 0.1% SDS, PIC)하고 4°C에서 16,000g로 5분간 원심분리합니다.
6.Wessel-Flugge 단백질 침전법으로 가수분해액을 침전시킵니다.
7.클릭 라벨링 반응 [0.1 mM 바이오틴-아지드, 1 mM 트리스(2-카르복시 에틸) 포스핀염산염]을 물에 녹입니다.
8. DMSO에 녹인 0.1 mM Tris[(1-benzyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]amine과 물에 녹인 1 mM CuSO₄를 넣고 37°C에서 어둠 속에서 2시간 동안 흔들고 배양합니다.
9.클릭 반응 후 시료을 10배 메탄올로 -80°C에서 밤새 침전시킨 후 원심분리하고 다시 차가운 메탄올로 세척합니다.
10.건조된 공을 4% SDS로 소생시킵니다.
11. 클릭 단백질을 고용량 Neutravidin Agarose 수지로 침전시킵니다.
12. 1% SDS로 시료을 세척하고 용출한 후 면역블로팅으로 추가 분석합니다.
*이 프로토콜은 단지 가이드라인을 제공하고 구체적인 필요에 따라 수정되어야 합니다.
References:
1.Linnemannstöns, Karen et al. “Ykt6-dependent endosomal recycling is required for Wnt secretion in the Drosophila wing epithelium.” Development (Cambridge, England) vol. 147,15 dev185421. 14 Aug. 2020, doi:10.1242/dev.185421
제품 문서 (Product Documents)
Purity:>99.50%Appearance:A solid
화학적 특성 (Chemical Properties)
CAS 번호
99208-90-9
동의어
Alk-14
화학명
15-hexadecynoic acid
SMILES
C#CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O
분자식
C16H28O2
분자량
252.4
용해도
20mg/mL in DMSO, 30mg/mL in DMF, 30mg/mL in ethanol
보관
Store at -20°C
일반 주의사항
제품의 용해도 데이터에 따라 적절한 용매를 선택하십시오. 조제 후에는 반복적인 동결·해동을 피할 수 있도록 저장 용액을 소분하십시오.
저장 용액은 -80°C 보관 시 6개월 이내, -20°C 보관 시 1개월 이내에 사용하십시오.
용해도를 높이려면 튜브를 37°C로 데운 뒤 적절한 시간 동안 초음파 처리하십시오.
저장 용액은 -80°C 보관 시 6개월 이내, -20°C 보관 시 1개월 이내에 사용하십시오.
용해도를 높이려면 튜브를 37°C로 데운 뒤 적절한 시간 동안 초음파 처리하십시오.
배송 조건
평가용 샘플은 아이스팩과 함께 배송됩니다. 그 외 용량은 실온 배송되며, 요청 시 아이스팩과 함께 배송할 수 있습니다.
계산 도구 (Calculators)몰 농도 / 희석 / 분자량 / 단위 변환 / 생체 내 제형 / 용해도
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