Alexa Fluor 647 NHS ester TEA es un tinte fluorescente ampliamente utilizado que contiene un grupo carboxilo activado para etiquetar sustratos con aminas primarias (R-NH2), como proteínas, oligonucleotides y ácidos nucleicos, y tiene una longitud de onda de excitación máxima de 650nm y una longitud de onda máxima de emisión de 665nm[1-2]. N-hydroxysuccinimide (NHS) esters pueden sufrir reacciones de sustitución nucleofílica con proteínas que contienen una cisteína N-terminal, formando nuevos enlaces amida y permitiendo así el etiquetado de proteínas [3]. Alexa Fluor 647 NHS ester TEA funciona bien en condiciones de imagen de Direct Stochastic Optical Reconstruction Microscopy (dSTORM) y es ampliamente utilizado para bioimagen celular y microscopía de superresolución [4]. Bajo condiciones de imagen de microscopio, la isomerización fotoinducida reversible del Alexa Fluor 647 NHS ester TEA utilizado en la microscopía de fluorescencia de superresolución sufre un “parpadeo” inducido por la luz, lo que permite la localización de fluoróforos con resolución espacial más allá del lñimite de difracción óptica. El rendimiento cuántico de fotoblanquecido permanente del Alexa Fluor 647 NHS ester TEA es muy bajo y puede ser parcialmente suprimido por un tampón redox anaeróbico[5]. Alexa Fluor 647 NHS ester TEA también se puede utilizar en combinación con reactivos de etiquetado como la faloidina para la tinción de líneas celulares, así como para la tinción de vesículas unilamelares gigantes (GUVs)[6-7].
References:
[1] Anderson GP, Nerurkar NL. Improved fluoroimmunoassays using the dye Alexa Fluor 647 with the RAPTOR, a fiber optic biosensor. J Immunol Methods. 2002;271(1-2):17-24.
[2] Wuethrich I, Guillen E, Ploegh HL. A mouse monoclonal antibody against Alexa Fluor 647. Monoclon Antib Immunodiagn Immunother. 2014;33(2):109-120.
[3] Jiang H, D'Agostino GD, Cole PA, Dempsey DR. Selective protein N-terminal labeling with N-hydroxysuccinimide esters. Methods Enzymol. 2020;639:333-353.
[4] Fan S, Webb JEA, Yang Y, et al. Observing the Reversible Single Molecule Electrochemistry of Alexa Fluor 647 Dyes by Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy. Angew Chem Int Ed Engl. 2019;58(41):14495-14498.
[5] Karlsson JKG, Laude A, Hall MJ, Harriman A. Photo-isomerization of the Cyanine Dye Alexa-Fluor 647 (AF-647) in the Context of dSTORM Super-Resolution Microscopy. Chemistry. 2019;25(65):14983-14998.
[6] Moghal MMR, Islam MZ, Sharmin S, Levadnyy V, Moniruzzaman M, Yamazaki M. Continuous detection of entry of cell-penetrating peptide transportan 10 into single vesicles. Chem Phys Lipids. 2018;212:120-129.
[7] Bharadwaj A, Kumar A, Mitra R, Jaganathan BG, Boruah BR. Enhanced fluorescence blinking of AF647 fluorophores in Mowiol via violet and UV light induced recovery for superior localization microscopy. Methods Appl Fluoresc. 2024;12(3):10.1088/2050-6120/ad4ae6.
















