GLPBio

Didemnin B

Catalog No.: GC49153Purity:>98.00%Synonyms: NSC 325319, NSC 333841
Didemnin B هو ديبسيببتيد دوري منتج بالخيوط البحرية التي ترتبط بشكل خاص بالتنية المرتبطة بGTP من EEF1A، مما يثبط إفرازه من موقع A الريبوسومي ويمنع تمدد البيبتيد اللاحق.

المنتجات مخصصة للاستخدام البحثي فقط، وليست للاستخدام البشري. نحن لا نبيع للمرضى.


Didemnin B
Cas No.: 77327-05-0
10mM (in 1mL DMSO)In Stock
$814.00
1
1mgIn Stock
$203.00
1

المراجع (Citations)

لا تتوفر حاليًا مراجع لهذا المنتج. فيما يلي مجموعة مختارة من المنشورات التي تستشهد بمنتجات GlpBio.
  • Nature cover
    Nature
    641, 529–536 (2025)
  • Nature cover
    Nature
    628, 630–638 (2024)
  • Nature cover
    Nature
    632, 686–694 (2024)
  • Nature cover
    Nature
    618, 1017–1023 (2023)
  • Nature cover
    Nature
    610, 366–372 (2022)
  • Cell cover
    Cell
    187(9):2288-2304 (2024)
  • Cell cover
    Cell
    183(7):1867-1883 (2020)
  • Science cover
    Science
    388(6745) (2025)
  • Science cover
    Science
    387(6739) (2025)
  • Science cover
    Science
    387(6734) (2025)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    35, 97–116 (2025)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    34, 683–706 (2024)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    33, 273–287 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    33, 546–561 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    33, 904–922 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    31, 1291–1307 (2021)

الوصف (Description)

Didemnin B هو ديبسيببتيد دوري منتج بالخيوط البحرية التي ترتبط بشكل خاص بالتنية المرتبطة بGTP من EEF1A، مما يثبط إفرازه من موقع A الريبوسومي ويمنع تمدد البيبتيد اللاحق. Didemnin B يثبط بشكل خاص إفراز eEF1A-1 من موقع A الريبوسومي، مما يمنع انتقال peptidyl-tRNA وتمدد البيبتيد اللاحق. إنه عامل مثبط للمناعة ومضاد للفيروسات والسرطان.

يمنع Didemnin B (80 nM,48h) الارتفاع من بروتين GRP78 في خلايا HepG2، في الارتباط بالتثبط المستمر من توليف البروتين. البيبتيدات الحلقية غير المرتبطة من الناحية الهيكلية didemnin B وternatin-4 تربط بمركب ثلاثي eEF1A(GTP)-aa-tRNA وتثبط النقل ولكن لها التأثيرات المختلفة على توليف البروتين في المختبر وفي الجسم الحي. من خلال الربط إلى موقع عادي على eEF1A و didemnin B وternatin-4 trap eEF1A في حالة وسيطة من خيار aa-tRNA، منع إفراز eEF1A وإقامة aa-tRNA على الريبوسوم. يمكن لDidemnin B تحفيز موت الخلايا المبرمج في مجموعة واسعة من خطوط خلية المنقولة.

التدخل الحاد باستخدام مثبط EEF1A وdidemnin B يعزز السمية الدهنية للكبد في الفيران السمينة مع NAFLD من خلال الآلة ولا يعتمد على تقليل أكل الطعام، مما يظهر أن أسلوب علاجي قوي لهذا المرض المتعلق بالضغط ER. يعزز Didemnin B تنكس دهني كبدي وتحمل الجلوكوز ودهون الدم في السمنة، ويرتبط ذلك بزيادة مناسبة و ربما هرمونية من المسارات المتعلقة باستجابة إجهاد الخلية وتوازن الطاقة في الكبد.

References:
[1]. Marco E, MartÍn-SantamarÍa S, et,al. Structural basis for the binding of didemnins to human elongation factor eEF1A and rationale for the potent antitumor activity of these marine natural products. J Med Chem. 2004 Aug 26;47(18):4439-52. doi: 10.1021/jm0306428. PMID: 15317456.
[2]. Lee J, Currano JN, et,al. Didemnins, tamandarins and related natural products. Nat Prod Rep. 2012 Mar;29(3):404-24. doi: 10.1039/c2np00065b. Epub 2012 Jan 23. PMID: 22270031.
[3]. Stoianov AM, Robson DL, et,al. Elongation Factor 1A-1 Is a Mediator of Hepatocyte Lipotoxicity Partly through Its Canonical Function in Protein Synthesis. PLoS One. 2015 Jun 23;10(6):e0131269. doi: 10.1371/journal.pone.0131269. PMID: 26102086; PMCID: PMC4478042.
[4]. Hetherington AM, Sawyez CG, et,al. Treatment with didemnin B, an elongation factor 1A inhibitor, improves hepatic lipotoxicity in obese mice. Physiol Rep. 2016 Sep;4(17):e12963. doi: 10.14814/phy2.12963. PMID: 27613825; PMCID: PMC5027364.
[5]. Juette MF, Carelli JD, et,al. Didemnin B and ternatin-4 differentially inhibit conformational changes in eEF1A required for aminoacyl-tRNA accommodation into mammalian ribosomes. Elife. 2022 Oct 20;11:e81608. doi: 10.7554/eLife.81608. PMID: 36264623; PMCID: PMC9584604.
[6]. Baker MA, Grubb DR, et,al. Didemnin B induces apoptosis in proliferating but not resting peripheral blood mononuclear cells. Apoptosis. 2002 Oct;7(5):407-12. doi: 10.1023/a:1020078907108. PMID: 12207173.
[7]. Wilson RB, Chen YJ, et,al.The marine compound and elongation factor 1A1 inhibitor, didemnin B, provides benefit in western diet-induced non-alcoholic fatty liver disease. Pharmacol Res. 2020 Nov;161:105208. doi: 10.1016/j.phrs.2020.105208. Epub 2020 Sep 22. PMID: 32977024.

البروتوكول (Protocol)

[1]eEF1A·GTP·Mg2+ وDidemnin B·eEF1A·GTP·Mg2+ الديناميكيات الجزيئية من مركب ثلاثي:

طريقة التحضير

تمت إذابة مركب eEF1A·GTP·Mg2+ وDidemnin B·eEF1A·GTP·Mg2+ بإضافة قشرة كروية من حوالي 3000 جزيئات ماء TIP3P متمركز عند CG1 في Leu77. نصف القطر من هذه قشرة الماء 35 Å لتحديد الإذابة من شق بين المجالات في كلا المركبين. هذه جزيئات الماء تم تقليل طاقتها أولا، ثم تم سماح الإفراز للماء وبقايا البروتين. في كل حالة، تم اتباع 1000 خطوة من الأكثر الانحدار حدة ب2000 خطوة من خفض الطاقة بطريقة التدرج المرافق. تم استخدام مجموعات الإحداثيات النهائية كمدخل لمحاكاة MD اللاحقة. تم استخدام SHAKE لجميع الروابط، وكانت الخطوة الزمنية للتكامل 2 fs. جزيئات الماء خالية من الانسحاب لأول من 100 ps. لبقايا 2000 ps، النظام الكامل سُمح بالإفراز.

ظروف التفاعل

\

التطبيقات

Didemnin B يرتبط بشكل خاص بeEF1A-1 المرتبط بGTP، في مكان بين aa-tRNA-binding وGTP-binding domains، ولكنه مميز من actin-binding domain. لذلك، Didemnin B يثبط بشكل خاص إفراز eEF1A-1 من موقع A الريبوسومي، مما يمنع انتقال peptidyl-tRNA وتمدد البيبتيد اللاحق.

تجربة الخلية [2]:

خطوط الخلايا

خلايا HepG2

طريقة التحضير

تم علاج الخلايا ببالمتيت، مع أو بدون 80 nM من didemnin B، تبعه قياس إجهاد ER (6 ساعة)، وتوليف البروتين (6-24 ساعة)، وموت الخلية (48 ساعة).

ظروف التفاعل

80 nM من didemnin B ل6-48ساعة

التطبيقات

يمنع Didemnin B (80 nM,48h) الارتفاع من بروتين GRP78 في خلايا HepG2، في الارتباط بالتثبط المستمر من توليف البروتين.

تجربة على الحيوانات [3]:

نماذج حيوانية

ذكور فيران C57BL/6J وعمرها 5 أسابيع وفيران leptin-deficient (ob/ob) على أساس C57BL/6J

طريقة التحضير

استخدام ذكور فيران C57BL/6J وعمرها 5 أسابيع وفيران leptin-deficient (ob/ob). تم إطعام جميع الفيران نظام غذائي AIN-76A. خلال الأسبوع الخامس، تم إعطاء الفيران حقن i.p. من didemnin B (50 μg/kg) أو التحكم الوهمي في اليوم 1 و4 و7.

شكل الجرعة

didemnin B (50 μg/kg) في اليوم 1 و4 و7. (حقن i.p.)

التطبيقات

علاج Didemnin B قلل بشكل خفيف الاستهلاك في الفيران السمينة.

References:
[1]. Marco E, Martín-Santamaría S, et,al. Structural basis for the binding of didemnins to human elongation factor eEF1A and rationale for the potent antitumor activity of these marine natural products. J Med Chem. 2004 Aug 26;47(18):4439-52. doi: 10.1021/jm0306428. PMID: 15317456.
[2]. Stoianov AM, Robson DL, et,al. Elongation Factor 1A-1 Is a Mediator of Hepatocyte Lipotoxicity Partly through Its Canonical Function in Protein Synthesis. PLoS One. 2015 Jun 23;10(6):e0131269. doi: 10.1371/journal.pone.0131269. PMID: 26102086; PMCID: PMC4478042.
[3]. Hetherington AM, Sawyez CG, et,al.Treatment with didemnin B, an elongation factor 1A inhibitor, improves hepatic lipotoxicity in obese mice. Physiol Rep. 2016 Sep;4(17):e12963. doi: 10.14814/phy2.12963. PMID: 27613825; PMCID: PMC5027364.

وثائق المنتج (Product Documents)

Purity:>98.00%Appearance:A crystalline solid

الخصائص الكيميائية (Chemical Properties)

رقم CAS
77327-05-0
المرادفات
NSC 325319, NSC 333841
SMILES
O=C1N2[C@](CCC2)([H])C(N([C@H](C(O[C@@H]([C@@H](C(N[C@]([C@H](CC(O[C@H](C([C@@H](C(N[C@H]1CC(C)C)=O)C)=O)C(C)C)=O)O)([H])[C@@H](C)CC)=O)NC([C@@H](CC(C)C)N(C)C([C@H]3N(C([C@@H](O)C)=O)CCC3)=O)=O)C)=O)CC4=CC=C(C=C4)OC)C)=O
الصيغة الجزيئية
C57H89N7O15
الوزن الجزيئي
1112.4
الذوبانية
Acetonitrile: 1 mg/ml
التخزين
Store at -20°C
شروط الشحن
تُشحن عينات التقييم مع عبوات تبريد. وتُشحن الأحجام الأخرى المتاحة في درجة حرارة الغرفة، أو مع عبوات تبريد عند الطلب.

الحاسبات (Calculators)المولارية / التخفيف / الوزن الجزيئي / تحويل الوحدات / تركيبة داخل الجسم الحي / الذوبانية

g/mol

Reviews

Review for Didemnin B

Rating: 5
  • 5 Star100%
  • 4 Star0%
  • 3 Star0%
  • 2 Star0%
  • 1 Star0%