引用文献 (Citations)
7 publications本製品を使用した研究者による文献製品説明 (Description)
TBTA(トリス(ベンジルトリアゾリルメチル)アミン)は、1,2,3-トリアゾール基を有する第3級アミンである。TBTAは銅(I)と錯体を形成し、銅(I)の酸化状態を安定化させることでクリック反応触媒作用を促進する。TBTAは、銅触媒によるアジド-アルキン環化付加反応(CuAAC)において、最も広く使用されている水不溶性配位子の一つである。
クリックケミストリーは、様々なコンジュゲートの合成に使用できる汎用性の高い反応である。クリックケミストリーを用いれば、蛍光色素やビオチンなどの低分子で、事実上あらゆる生体分子を簡単に標識することができる。
クリックケミストリー反応は、アジドとアルキン(末端アセチレン)という2つの成分の間で起こる。アジド基もアルキン基も、天然の生体分子にはほとんど存在しない。従って、この反応は高度にバイオオルソゴナル的で特異的である。
References:
[1] Alireza Movahedi, et al. One-pot synthesis of TBTA-functionalized coordinating polymers. Reactive and Functional Polymers.2014. 82:1-8.
[2] Kennedy D C, McKay C S, Legault M C B, et al. Cellular consequences of copper complexes used to catalyze bioorthogonal click reactions[J]. Journal of the American Chemical Society, 2011, 133(44): 17993-18001.
[3] Hagmann V, Sommer S, Fabian P, et al. Chemically monoubiquitinated PEX5 binds to the components of the peroxisomal docking and export machinery[J]. Scientific Reports, 2018, 8(1): 16014.
実験プロトコル (Protocol)
このプランはあくまでガイドラインであり、具体的なニーズに合わせて修正してください。
1.クリックケミストリー標識に必要な試薬量を下表を用いて計算する。必要なストック溶液を準備する。
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試薬 |
混合物中の最終濃度 |
原液濃度 |
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オリゴヌクレオチド、アルキン修飾 |
各種(20-200uM) |
各種 |
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アジド |
1.5x(オリゴヌクレオチド濃度) |
DMSO中10mM |
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DMSO |
50vol% |
— |
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アスコルビン酸 |
0.5mM |
水中5mM |
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Cu-TBTA複合体 |
0.5mM |
55vol%DMSO中10mM |
2.アルキン修飾オリゴヌクレオチドまたはDNAを耐圧バイアルに入れ、水に溶かす。
3.2M酢酸トリエチルアンモニウム緩衝液(pH7.0)を最終濃度0.2Mになるように加える。
4.DMSOを加え、ボルテックスする。
5.アジド原液(DMSO中10mM)を加え、ボルテックスする。
6.必要量の5mMアスコルビン酸ストック溶液を加え、短時間ボルテックスする。
7.不活性ガスを30秒間バブリングして溶液を脱気する。窒素、アルゴン、ヘリウムが使用できる。
8.必要量の55vol%DMSO中の10mM銅(II)-TBTASストックを混合液に加える。不活性ガスでバイアルを洗浄し、キャップを閉める。
9.混合液を十分にボルテックスする。アジ化物の著しい沈殿が観察された場合は、バイアルを80℃で3分間加熱し、ボルテックスする。
10.室温で一晩静置する。
11. アセトン(オリゴヌクレオチドの場合)またはエタノール(DNAの場合)でコンジュゲートを沈殿させる。完全に混合し、-20℃で20分間保存する。
オリゴヌクレオチド結合体を沈殿させる場合:混合液にアセトン中3%過塩素酸リチウムを少なくとも4倍過剰量加える(混合液の量が多い場合は、複数のバイアルに分ける)。
DNAコンジュゲートを沈殿させるには:混合液に酢酸ナトリウムを最終濃度0.3Mになるように加え、2.5容量のエタノール(または0.8容量のイソプロパノール)を加える。
12.10000rpmで10分間遠心する。
13.上清を捨てる。ペレットをアセトン(1mL)で洗浄し、10000rpmで10分間遠心する。
14.上清を捨て、ペレットを乾燥させ、RP-HPLCまたはPAGEでコンジュゲートを精製する。
付録:クリックケミストリー標識およびコンジュゲーションに使用する試薬のストック溶液の調製。
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5mMアスコルビン酸ストック |
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調製法 |
18mgのアスコルビン酸を20mLの蒸留水に溶かす。 |
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貯蔵 |
アスコルビン酸は空気によって容易に酸化される。溶液は一日安定している。新鮮な製剤を使用してください |
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55%DMSO中の10mM銅(II)-TBTAストック |
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調製 |
硫酸銅(II)五水和物50mgを蒸留水10mLに溶かす。116mgのTBTAリガンドを11mLのDMSOに溶かす。2つの溶液を混合する |
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保存 |
室温で保存する。溶液は数年間安定である。 |
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酢酸トリエチルアンモニウムバッファー、pH 7.0 |
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調製 |
2.78mLのトリエチルアミンと1.14mLの酢酸を混合する。10mLの水を加え、pHを7.0に調整する。 |
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保存 |
常温で保存する。溶液は数年間安定である。 |
製品資料 (Product Documents)
化学的性質 (Chemical Properties)
ストック溶液は、-80°Cで保存する場合は6か月以内、-20°Cで保存する場合は1か月以内に使用してください。
溶解性を高めるには、チューブを37°Cに温め、適切な時間超音波処理してください。
計算ツール (Calculators)モル濃度 / 希釈 / 分子量 / 単位変換 / in vivo製剤 / 溶解度
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