IF 21
PMID: 38671262 ↗Palmitic Acid Alkyne
Catalog No.: GC40292Purity:>99.50%Synonyms: Alk-14
Palmitic Acid Alkyne es un ácido palmítico con un alquino ω-terminal alkyne y un reactivo de quí,ica de clic que actúa como un enlazador PROTAC basado en cadena de alquilo con moléculas que contienen grupos de azida
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Cas No.: 99208-90-9
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Palmitic Acid Alkyne es un ácido palmítico con un alquino ω-terminal alkyne y un reactivo de quí,ica de clic que actúa como un enlazador PROTAC basado en cadena de alquilo con moléculas que contienen grupos de azida [1]. Palmitic acid alkyne se aplica en la detección de proteínas, la unión del tráfico conjugativo, los vectores de asistencia por imágenes y los enlazadores PROTAC [2,3,4,5].
References:
[1] Honcharenko, Dmytro et al. “New Alkyne and Amine Linkers for Versatile Multiple Conjugation of Oligonucleotides.” *ACS omega* vol. 6,1 579-593. 18 Dec. 2020, doi:10.1021/acsomega.0c05075
[2] Yap, Megan C et al. “Rapid and selective detection of fatty acylated proteins using omega-alkynyl-fatty acids and click chemistry.” *Journal of lipid research* vol. 51,6 (2010): 1566-80. doi:10.1194/jlr.D002790
[3] García-Cazorla, Yolanda et al. “Conjugation inhibitors compete with palmitic acid for binding to the conjugative traffic ATPase TrwD, providing a mechanism to inhibit bacterial conjugation.” *The Journal of biological chemistry* vol. 293,43 (2018): 16923-16930. doi:10.1074/jbc.RA118.004716
[4] Paiva, Eduardo M, and Florian M Schmidt. “Ultrafast Widefield Mid-Infrared Photothermal Heterodyne Imaging.” *Analytical chemistry* vol. 94,41 (2022): 14242-14250. doi:10.1021/acs.analchem.2c02548
[5] Gao, Xinxin, and Rami N Hannoush. “A Decade of Click Chemistry in Protein Palmitoylation: Impact on Discovery and New Biology.” *Cell chemical biology*vol. 25,3 (2018): 236-246. doi:10.1016/j.chembiol.2017.12.002
Protocolo (Protocol)
Haga clic en el ensayo de palmitoilación
1.Células HEK293T de semillas y células transfectas con plásmidos (YKT6-WT BioID, YKT6-3E BioID y Wnt3A) en DMEM suplementado con 10% de FBS.
2.Disuelve ω-Alkynyl palmitic acid (Palmitic Acid Alkyne) a una concentración final de in ethanol to a final concentration of en etanol hasta una concentración final de 50mM y se almacena a −80°C.
3.Diluir Palmitic acid alkyne a una concentración final de 100μM en DMEM suplementado con un 5% de FBS (libre de ácidos grasos) sonicado durante 15 minutos a temperatura ambiente en un baño de agua y luego se permite el precimplejo durante otros 15 minutos.
4.Agregue un medio que contenga Palmitic acid alkyne y reemplace parcialmente después de 24h.
5.A las 72h después de la transfección, las células de lisis (PBS con 1% de Triton x-100, 0.1% de SDS, PIC), luego centrifugan a 16,000g durante 5 minutos a 4°C.
6.Precipitar lisados con precipitación de proteína Wessel-Flugge.
7.Disuelva la reacción de marcado de clic [0.1mM de biotin-azide, 1mM de Tris(2-carboxyethyl)phosphine hydrochloride] en agua
8.Incubar con 0.1mM Tris[(1-benzyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]amine disuelto en DMSO y 1mM de CuSO4 en agua agitando durante 2h a 37°C en condiciones oscuras.
9.Después de la reeacción de clic, precipitar las muestras con 10× metanol durante la noche a −80°C, luego centrifugar y lavar de nuevo con metanol helado
10.Vuelva a suspender el gránulo seco en SDS al 4%.
11. Precipitar proteínas biotiniladas por clic con resina de agarosa de neutravidina de alta capacidad.
12.Lave las muestras con un 1% de SDS y elúelas, luego analícelas más a fondo mediante inmunobloqueo.
*Este protocolo solo proporciona una guía, y debe modificarse de acuerdo a sus necesidades específicas
References:
1.Linnemannstöns, Karen et al. “Ykt6-dependent endosomal recycling is required for Wnt secretion in the Drosophila wing epithelium.” Development (Cambridge, England) vol. 147,15 dev185421. 14 Aug. 2020, doi:10.1242/dev.185421
Documentos del producto (Product Documents)
Purity:>99.50%Appearance:A solid
Propiedades químicas (Chemical Properties)
N.º CAS
99208-90-9
Sinónimos
Alk-14
Nombre químico
15-hexadecynoic acid
SMILES
C#CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O
Fórmula molecular
C16H28O2
Peso molecular
252.4
Solubilidad
20mg/mL in DMSO, 30mg/mL in DMF, 30mg/mL in ethanol
Almacenamiento
Store at -20°C
Consejos generales
Seleccione un disolvente adecuado según los datos de solubilidad del producto. Una vez preparada, divida la solución madre en alícuotas para evitar ciclos repetidos de congelación y descongelación.
Utilice las soluciones madre en un plazo de 6 meses si se conservan a -80°C, o de 1 mes si se conservan a -20°C.
Para mejorar la solubilidad, caliente el tubo a 37°C y soníquelo durante un periodo adecuado.
Utilice las soluciones madre en un plazo de 6 meses si se conservan a -80°C, o de 1 mes si se conservan a -20°C.
Para mejorar la solubilidad, caliente el tubo a 37°C y soníquelo durante un periodo adecuado.
Condiciones de envío
Las muestras de evaluación se envían con acumuladores de frío. Los demás tamaños se envían a temperatura ambiente o, previa solicitud, con acumuladores de frío.
Calculadoras (Calculators)Molaridad / Dilución / Peso molecular / Conversión de unidades / Formulación in vivo / Solubilidad
g/mol
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Review for Palmitic Acid Alkyne
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