Bobcat 339는 TET1에 대한 IC50 값이 33μM, TET2에 대한 IC50 값이 73μM이고 DNA 메틸트랜스퍼라제 DNMT3a를 억제하지 않는 새로운 사이토신 기반의 TET 효소 억제제로 좋은 선택성을 보인다. TET 효소는 DNA메틸 전이효소를 촉진하고 세포 분화 및 발달을 조절하는 주요 후생학적 수정제이다[2]. 5-메틸사이토신(5mC)의 TET 매개 산화를 경쟁적으로 억제해서 Bobcat 339는 후생학적 연구에서 TET 기능을 조사하고 관련 질병 모델에서 기전을 명확히 하기 위해 특히 적합한다[3,4].
체외 실험에서 1%DMSO에 녹인 10μM의 Bobcat 339로 쥐 해마 신경세포 HT-22를 24시간 처리하면 5-hydroxymethylcytosine (5hmC)의 전반적인 수준이 현저하게 감소한다[1]. 쥐 시상하부 신경세포 GT1-7를 10μM의 Bobcat 339와 6시간 동안 함께 배양하면 TET3 단백질의 발현이 줄어들지만 그 mRNA의 양에는 영향을 미치지 않는다[5]. 게다가 인간 유방암 세포 MDA-MB-231에 25μM의 Bobcat 339를 72시간 처리하면 FANCA 유전자의 발현이 줄어들고 TET를 억제해서 세포 증식이 현저하게 억제된다[6].
체내 실험에서 시상하부의 아그루티-관련 펩타이드(AgRP) 신경세포에서 녹색 형광 단백질(GFP)이 특이적으로 발현되는 쥐들에게 복강 주사로 Bobcat 339(2.5mg/kg)를 투여하면 2일 이내에 TET3 양성 AgRP 신경세포가 눈에 띄게 줄어들고 신경세포 활성이 증가한다(FOS 단백질 발현이 증가함을 통해 나타난다)[5]. C57BL/6 쥐에서 일시적 대뇌 중동맥 폐색(tMCAO)과 지방다당류(LPS) 유도(10mg/kg; 복강 주사)의 과염증 상태에서 3일 연속 Bobcat 339(10mg/kg/일)을 정맥 투여하면 뇌경색 부피가 현저하게 줄어들고 신경학적 기능 회복이 개선된다[7].
References:
[1] CHUA G N L, WASSARMAN K L, SUN H, et al. Cytosine-based TET enzyme inhibitors[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2019, 10(2): 180-185.
[2] WEIRATH N A, HURBEN A K, CHAO C, et al. Small molecule inhibitors of TET dioxygenases: Bobcat339 activity is mediated by contaminating copper (II)[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2022, 13(5): 792-798.
[3] FENG J, SHAO N, SZULWACH K E, et al. Role of Tet1 and 5-hydroxymethylcytosine in cocaine action[J]. Nature Neuroscience, 2015, 18(4): 536-544.
[4] XU Y, YANG Y, WANG Z, et al. ZNF397 deficiency triggers TET2-driven lineage plasticity and AR-targeted therapy resistance in prostate cancer[J]. Cancer Discovery, 2024, 14(8): 1496-1521.
[5] LV H, CATARINO J, LI D, et al. A small-molecule degrader of TET3 as treatment for anorexia nervosa in an animal model[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2023, 120(16): e2300015120.
[6] LUO L, YUAN F, PALOVCAK A, et al. Oncogenic properties of wild-type DNA repair gene FANCA in breast cancer[J]. Cell Reports, 2025, 44(4): 115480.
[7] WANG Y, ZHANG L, LYU T, et al. Association of DNA methylation/demethylation with the functional outcome of stroke in a hyperinflammatory state[J]. Neural Regeneration Research, 2024, 19(10): 2229-2239.