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Zebularine

Catalog No.: GC12153Purity:>98.00%
Zebularine, una ciudadina sin grupo amino en la posición 4, es un inhibidor de las DNA methylation DNMT que superime la metilación del DNA

Los productos son exclusivamente para uso en investigación. No aptos para uso humano. No vendemos a pacientes.


Zebularine
Cas No.: 3690-10-6
10mM (in 1mL DMSO)In Stock
$27.00
1
5mgIn Stock
$25.00
1
10mgIn Stock
$40.00
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50mgIn Stock
$154.00
1
100mgIn Stock
$231.00
1

Citas (Citations)

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  • Nature cover
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    641, 529–536 (2025)
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    628, 630–638 (2024)
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    Nature
    632, 686–694 (2024)
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    Nature
    618, 1017–1023 (2023)
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    Nature
    610, 366–372 (2022)
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    Cell
    187(9):2288-2304 (2024)
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    Cell
    183(7):1867-1883 (2020)
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    Science
    388(6745) (2025)
  • Science cover
    Science
    387(6739) (2025)
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    Science
    387(6734) (2025)
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    Cell Research
    35, 97–116 (2025)
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    34, 683–706 (2024)
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    Cell Research
    33, 273–287 (2023)
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    33, 546–561 (2023)
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    Cell Research
    33, 904–922 (2023)
  • Cell Research cover
    Cell Research
    31, 1291–1307 (2021)

Descripción (Description)

Zebularine, una ciudadina sin grupo amino en la posición 4, es un inhibidor de las DNA methylation DNMT que superime la metilación del DNA[1]. Este compuesto provoca desmetilación del DNA y aumenta la actividad de la vía cGAS-STING, lo que induce la acumulación de fragmentos de DNA en el citosol[2]. Zebularine se emplea en sistemas celulares para inhibir el desarrollo tumoral y modificar la expresión génica en células cancerosas[3].

In vitro, el tratamiento con Zebularine durante 24 horas redujo la viabilidad de las células HCCLM3, MHCC97H y MHCC97L, con valores de IC50 de 56.75µM, 59.72µM y 64.93µM, respectivamente[4]. El tratamiento de células MDA-MB-231 con 200µM de Zebularine durante 96 horas inhibió la proliferación celular, provocó la detención del ciclo en fase S y disminuyó la expresión de las ciclinas B y D[5]. El tratamiento de células A549 con 100µM de Zebularine durante 72h indujo apoptosis, acompañada de pérdida del potencial transmembranal mitocondrial, reducción de Bcl-2, incremento de Bax y p53, y activación de caspase-3 y caspase-8[6].

In vivo, la administración oral de Zebularine a dosis de 100mg/kg cada cuatro días durante 20 días inhibió de forma notable el desarrollo tumoral en el modelo murino de xneoinjerto con células BGC823[7]. La inyección intraperitoneal diaria de Zebularine (225mg/kg) durante siete días redujo la extrensión de3 lesiones fibróticas y los procesos inflamarios renal en un modelo murino de obstrucción ureteral unilateral (UUO)[8].

References:
[1] Champion C, Guianvarc'h D, Sénamaud-Beaufort C, et al. Mechanistic insights on the inhibition of c5 DNA methyltransferases by zebularine[J]. PloS one, 2010, 5(8): e12388.
[2] Lai J, Fu Y, Tian S, et al. Zebularine elevates STING expression and enhances cGAMP cancer immunotherapy in mice[J]. Molecular Therapy, 2021, 29(5): 1758-1771.
[3] Cheng J C, Yoo C B, Weisenberger D J, et al. Preferential response of cancer cells to zebularine[J]. Cancer cell, 2004, 6(2): 151-158.
[4] Sanaei M, Kavoosi F. Effect of zebularine on apoptotic pathways in hepatocellular carcinoma cell lines[J]. International Journal of Preventive Medicine, 2023, 14(1): 63.
[5] Billam M, Sobolewski M D, Davidson N E. Effects of a novel DNA methyltransferase inhibitor zebularine on human breast cancer cells[J]. Breast cancer research and treatment, 2010, 120(3): 581-592.
[6] You B R, Park W H. Zebularine inhibits the growth of A549 lung cancer cells via cell cycle arrest and apoptosis[J]. Molecular Carcinogenesis, 2014, 53(11): 847-857.
[7] Tan W, Zhou W, Yu H, et al. The DNA methyltransferase inhibitor zebularine induces mitochondria-mediated apoptosis in gastric cancer cells in vitro and in vivo[J]. Biochemical and biophysical research communications, 2013, 430(1): 250-255.
[8] Koh E S, Kim S, Son M, et al. The protective effect of zebularine, an inhibitor of DNA methyltransferase, on renal tubulointerstitial inflammation and fibrosis[J]. International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23(22): 14045.

Protocolo (Protocol)

Experimentos celulares [1]:

Líneas celulares

Células HCCLM3 cells

Método de preparación

Las células HCCLM3 se cultivaron en medio DMEM suplementado con un 10% de suero bovino fetal y antibióticos (0.1mg/ml de streptomycin y 100U/ml de penicillin) a 37°C y 5% de CO2 durante 24 horas. Posteriormente, todas las células HCCLM3 se sembraron en placas de 96 pozos (3×105 células por pozo). Después de 1 día, se retiró el medio y se añadió medio que contenía difrerentes concentraciones de Zebularine (0, 10, 25, 50, 75 y 100μM), mientras que el grupo de control se trató con DMSO al 0.05%. Después de 24 horas de tratamiento con Zebularine, se añadió solución de MTT (5mg/ml) a cada pozo y se incubó a 37°C durante 4 horas. Posteriroemente, la absorbancia se midió a una longitud de onda de 570nm utilizando un lector de microplacas. 

Condiciones de reacción

0, 10, 25, 50, 75 y 100μM; 24h

Áreas de aplicación

El tratamiento con Zebularine inhibió la viabilidad celular de las células HCCLM3 de unamanera dependiente de la dosis.
Experimentos con animales [2]:

Modelos animales

Ratones desnudos BALB/c hembra

Método de preparación

Las células BGC823 cse inyectaron en el flanco de ratones desnudos BALB/c (hembra, de 4-6 semanas de edad) y se mantuvieron en condiciones específicas libres de patógenos (SPF). Los ratones se dividieron en dos grupos: un grupo de control y un grupo experimental (100mg/kg; p.o). Cada grupo contenía cinco ratones desnudos (al menos seis tumores por grupo ; 1-2 ratones desnudos por grupo fueron sacrificados al azar y utilizados para establecer el curso temporal de la expresión). Cuando el volumen del tumor alcanzó los 100-150mm3, los ratones desnudos fueron tratados con gavage con Zebularine (disuelta en solución salina al 0.45%) cada 4 días durante 20 días. Al grupo de control se le administró una solución salina normal al 0.45% por gavage cada 4 días durante 20 días. El crecimiento tumoral se monitorizó midiendo el volumen del tumor (TV), que se calculó utilizando la fórmula: TV (mm3) = ancho2(mm2)×longitud(mm)/2.

Forma de dosificación

100mg/kg; cada cuatro días durante 20 días; p.o.

Áreas de aplicación

El tartamiento con Zebularine redujo el crecimiento del xenoinjerto tumoral en ratones. 

References:
[1] Sanaei M, Kavoosi F. Effect of zebularine on apoptotic pathways in hepatocellular carcinoma cell lines[J]. International Journal of Preventive Medicine, 2023, 14(1): 63.
[2] Tan W, Zhou W, Yu H, et al. The DNA methyltransferase inhibitor zebularine induces mitochondria-mediated apoptosis in gastric cancer cells in vitro and in vivo[J]. Biochemical and biophysical research communications, 2013, 430(1): 250-255.

Documentos del producto (Product Documents)

Purity:>98.00%Appearance:A solid

Propiedades químicas (Chemical Properties)

N.º CAS
3690-10-6
Nombre químico
1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
SMILES
C1=CN(C(=O)N=C1)C2C(C(C(O2)CO)O)O
Fórmula molecular
C9H12N2O5
Peso molecular
228.2
Solubilidad
DMF: 5 mg/ml,DMSO: 14 mg/ml,Ethanol: 0.25 mg/ml,PBS (pH 7.2): 10 mg/ml
Almacenamiento
Store at 2-8°C
Consejos generales
Seleccione un disolvente adecuado según los datos de solubilidad del producto. Una vez preparada, divida la solución madre en alícuotas para evitar ciclos repetidos de congelación y descongelación.
Utilice las soluciones madre en un plazo de 6 meses si se conservan a -80°C, o de 1 mes si se conservan a -20°C.
Para mejorar la solubilidad, caliente el tubo a 37°C y soníquelo durante un periodo adecuado.
Condiciones de envío
Las muestras de evaluación se envían con acumuladores de frío. Los demás tamaños se envían a temperatura ambiente o, previa solicitud, con acumuladores de frío.

Calculadoras (Calculators)Molaridad / Dilución / Peso molecular / Conversión de unidades / Formulación in vivo / Solubilidad

g/mol

Reviews

Review for Zebularine

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