ddhCTP |
Catalog No.GB20186
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ddhCTP는 선천적인 면역 반응에서 생성된 새로운 항바이러스 분자이고 다양한 황색 바이러스 RNA 종속 RNA polymerase (RdRps)의 체인 종료제이다.
Products are for research use only. Not for human use. We do not sell to patients.
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
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ddhCTP는 선천적인 면역 반응에서 생성된 새로운 항바이러스 분자이고 다양한 황색 바이러스 RNA 종속 RNA polymerase (RdRps)의 체인 종료제이다. Viperin은 자유질자 S-adenosyl-L-methionine (SAM) 효소 초가족의 구성원이고 다양한 RNA와 DNA 바이러스의 복제를 억제하는 데 관여하는 인터페론 유도 단백질로 뎅기 바이러스, 서니로 바이러스, Zika 바이러스, C형 감염 바이러스, 인플루엔자 A 바이러스, 랩시 바이러스, HIV 등을 포함한다[2, 3]. ddhCTP의 수정은 3'-하이드록시 그룹의 제거를 포함하고 촉기 사슬에 후속 핵간산 추가를 방지하고 RNA 체인 종료제 억제제로 작용한다[4]. ddhCTP는 DNA polymerase β와 DNA polymerase γ의 Ki 값이 각각 1.32μM와 0.034μM인 핵기서 유사물이다[5]. ddhCTP는 NAD+ 의존적으로 효소인 glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)의 활동을 억제할 수 있다[6].
References:
[1] Honarmand Ebrahimi K, Vowles J, Browne C, et al. ddhCTP produced by the radical‐SAM activity of RSAD2 (viperin) inhibits the NAD+‐dependent activity of enzymes to modulate metabolism[J]. FEBS letters, 2020, 594(10): 1631-1644.
[2] Gizzi A S, Grove T L, Arnold J J, et al. A naturally occurring antiviral ribonucleotide encoded by the human genome[J]. Nature, 2018, 558(7711): 610-614.
[3] Kennelly S A, Sawyer J M, Payne A F, et al. Development of 3′-Deoxy-3′, 4′-didehydro-nucleoside Prodrug Inhibitors of West Nile and Zika Viruses[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2024, 15(8): 1334-1339.
[4] Ciardullo G, Parise A, Prejanò M, et al. Viral RNA replication suppression of SARS-CoV-2: Atomistic insights into inhibition mechanisms of RdRp machinery by ddhCTP[J]. Journal of Chemical Information and Modeling, 2024, 64(5): 1593-1604.
[5] Cherrington J M, Allen S J, McKee B H, et al. Kinetic analysis of the interaction between the diphosphate of (S)-1-(3-hydroxy-2-phosphonylemthoxypropyl) cytosine, ddCTP, AZTTP, and FIAUTP with human DNA polymerases β and γ[J]. Biochemical pharmacology, 1994, 48(10): 1986-1988.
[6] Palmer C S. Innate metabolic responses against viral infections[J]. Nature Metabolism, 2022, 4(10): 1245-1259.
이 계획은 단지 가이드를 제공하고 구체적인 필요에 따라 수정하시기 바랍니다.
1.용액 준비
(1) 이 제품은 100mM 용액으로 제공됩니다. 사용할 때 실험 버퍼를 사용하여 ddhCTP를 희석하여 필요한 농도의 작업 용액을 준비합니다.
참고: 사용하지 않은 용액은 -20°C나 -80°C의 어두운 곳에 분사하여 보관하고 반복적인 동결과 해동을 피하도록 합니다. 작업 용액은 즉시 준비하고 사용되어야 합니다. 실제 상황에 따라 최적의 작업 농도를 조정하거나 문헌을 참고하여 구배 농도를 설정합니다.
2.SARS-CoV-2 RdRp는 ddhCTP를 입처 확장 반응의 종결자로 사용합니다[1]（출처 문헌, 참고용）
(1) RNA 템플릿 순서는 15μM CTP, 60μM ATP, 45μM GTP, 30μM UTP 및 다양한 농도(0-1.5mM)의 ddhCTP가 포함된 상태에서 37°C에서 25분 동안 배양되었습니다. 37°C에서 25분간 초기 배양 후 반응에는 200μM NTP 또는 물(로서 제어)이 추가되어 추가로 25분 동안 배양되었습니다. 이는 RdRp가 중단된 제품을 다시 확장할 수 있도록 허용합니다.
(2) 포름아마드를 89%로 추가하고 95°C에서 10분간 가열하여 반응을 종료합니다.
(3) 15%의 폴리아크릴아미드 TBE-우레아 변성 균열로 균열 전기를 통해 제품을 분리하고 균열 이미저에서 스캔합니다.
참고: 안전과 건강을 위해 수술시 실험가운과 일화용 장갑을 착용하시기 바랍니다.
References:
[1]Moeller N H, Passow K T, Harki D A, et al. SARS-CoV-2 nsp14 exoribonuclease removes the natural antiviral 3′-Deoxy-3′, 4′-didehydro-cytidine nucleotide from RNA[J]. Viruses, 2022, 14(8): 1790.
| Cas No. | SDF | ||
| Formula | C9H14N3O13P3 | M.Wt | 465.14 |
| Solubility | Storage | Store at -20°C or below | |
| General tips | Please select the appropriate solvent to prepare the stock solution according to the
solubility of the product in different solvents; once the solution is prepared, please store it in
separate packages to avoid product failure caused by repeated freezing and thawing.Storage method
and period of the stock solution: When stored at -80°C, please use it within 6 months; when stored
at -20°C, please use it within 1 month. To increase solubility, heat the tube to 37°C and then oscillate in an ultrasonic bath for some time. |
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| Shipping Condition | Evaluation sample solution: shipped with blue ice. All other sizes available: with RT, or with Blue Ice upon request. | ||
| Prepare stock solution | |||
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1 mg | 5 mg | 10 mg |
| 1 mM | 2.1499 mL | 10.7495 mL | 21.4989 mL |
| 5 mM | 430 μL | 2.1499 mL | 4.2998 mL |
| 10 mM | 215 μL | 1.0749 mL | 2.1499 mL |
Quality Control & SDS
- View current batch:
- Purity: >98.00% Appearance: A liquid
- COA (Certificate of Analysis)
- SDS (Safety Data Sheet)
- Datasheet
Average Rating: 5 (Based on Reviews and 30 reference(s) in Google Scholar.)