Bobcat 339は新規のシトシンに基づいたTET酵素阻害剤であり、優れた選択性を持ち、TET1に対するIC50値は33μMであり、TET2に対しては73μMであり、DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3aは阻害しない[1]。TET酵素は、DNAの脱メチル化を促進し、細胞の分化と発達を制御する肝心なエピジェネティック修飾因子である[2]。TET媒介の5-methylcytosine (5mC)の酸化を競合的に阻害することで、Bobcat 339はエピジェネティック研究におけるTET機能の調査や、関連疾患モデルにおけるメカニズムの解明には特に適している[3,4]。
体外で、10μM Bobcat 339 (1%DMSOの中)でマウス海馬体ニューロンHT-22細胞を24時間処理した結果、5-hydroxymethylcytosine (5hmC)の全体的なレベルを著しく減らした[1]。10μM Bobcat 339でマウス視床下部GT1-7ニューロン細胞を6時間培養した結果、そのmRNAの量を影響せずに、TET3タンパク質の発見を減らした[5]。更に、25μM Bobcat 339でヒト乳癌MDA-MB-231細胞を72時間処理した結果、TETの阻害を通じて、FANCA遺伝子発見を下方制御し、細胞の増殖を著しく阻害した[6]。
体内で、視床下部のアグーチ関連ペプチド（AgRP）ニューロンにおけるGFP特異性の発見を持つマウスに、Bobcat 339 (2.5mg/kg)を腹腔内注射した結果、2日以内に、TET3陽性のAgRPニューロンが著しく減少し、ニューロン活性が増えた（FOSタンパク質発見の上昇によって示唆された）[5]。一過性中大脳動脈閉塞症（tMCAO）を持ち、リポ多糖類（LPS）誘発（10mg/kg；腹腔内注射）の過剰炎症状態にあるC57BL/6マウスに、Bobcat 339 (10mg/kg/日)を3日間連続で静脈内投与した結果、脳梗塞容積を著しく減らし、神経機能の回復を改善した[7]。
References:
[1] CHUA G N L, WASSARMAN K L, SUN H, et al. Cytosine-based TET enzyme inhibitors[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2019, 10(2): 180-185.
[2] WEIRATH N A, HURBEN A K, CHAO C, et al. Small molecule inhibitors of TET dioxygenases: Bobcat339 activity is mediated by contaminating copper (II)[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2022, 13(5): 792-798.
[3] FENG J, SHAO N, SZULWACH K E, et al. Role of Tet1 and 5-hydroxymethylcytosine in cocaine action[J]. Nature Neuroscience, 2015, 18(4): 536-544.
[4] XU Y, YANG Y, WANG Z, et al. ZNF397 deficiency triggers TET2-driven lineage plasticity and AR-targeted therapy resistance in prostate cancer[J]. Cancer Discovery, 2024, 14(8): 1496-1521.
[5] LV H, CATARINO J, LI D, et al. A small-molecule degrader of TET3 as treatment for anorexia nervosa in an animal model[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2023, 120(16): e2300015120.
[6] LUO L, YUAN F, PALOVCAK A, et al. Oncogenic properties of wild-type DNA repair gene FANCA in breast cancer[J]. Cell Reports, 2025, 44(4): 115480.
[7] WANG Y, ZHANG L, LYU T, et al. Association of DNA methylation/demethylation with the functional outcome of stroke in a hyperinflammatory state[J]. Neural Regeneration Research, 2024, 19(10): 2229-2239.