Bobcat 339 (Synonyms: BC339) |
カタログ番号GC46935
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Bobcat 339は新規のシトシンに基づいたTET酵素阻害剤であり、優れた選択性を持ち、TET1に対するIC50値は33μMであり、TET2に対しては73μMであり、DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3aは阻害しない。
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Cas No.: 2280037-51-4
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
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Bobcat 339は新規のシトシンに基づいたTET酵素阻害剤であり、優れた選択性を持ち、TET1に対するIC50値は33μMであり、TET2に対しては73μMであり、DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3aは阻害しない[1]。TET酵素は、DNAの脱メチル化を促進し、細胞の分化と発達を制御する肝心なエピジェネティック修飾因子である[2]。TET媒介の5-methylcytosine (5mC)の酸化を競合的に阻害することで、Bobcat 339はエピジェネティック研究におけるTET機能の調査や、関連疾患モデルにおけるメカニズムの解明には特に適している[3,4]。
体外で、10μM Bobcat 339 (1%DMSOの中)でマウス海馬体ニューロンHT-22細胞を24時間処理した結果、5-hydroxymethylcytosine (5hmC)の全体的なレベルを著しく減らした[1]。10μM Bobcat 339でマウス視床下部GT1-7ニューロン細胞を6時間培養した結果、そのmRNAの量を影響せずに、TET3タンパク質の発見を減らした[5]。更に、25μM Bobcat 339でヒト乳癌MDA-MB-231細胞を72時間処理した結果、TETの阻害を通じて、FANCA遺伝子発見を下方制御し、細胞の増殖を著しく阻害した[6]。
体内で、視床下部のアグーチ関連ペプチド（AgRP）ニューロンにおけるGFP特異性の発見を持つマウスに、Bobcat 339 (2.5mg/kg)を腹腔内注射した結果、2日以内に、TET3陽性のAgRPニューロンが著しく減少し、ニューロン活性が増えた（FOSタンパク質発見の上昇によって示唆された）[5]。一過性中大脳動脈閉塞症（tMCAO）を持ち、リポ多糖類（LPS）誘発（10mg/kg；腹腔内注射）の過剰炎症状態にあるC57BL/6マウスに、Bobcat 339 (10mg/kg/日)を3日間連続で静脈内投与した結果、脳梗塞容積を著しく減らし、神経機能の回復を改善した[7]。
References:
[1] CHUA G N L, WASSARMAN K L, SUN H, et al. Cytosine-based TET enzyme inhibitors[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2019, 10(2): 180-185.
[2] WEIRATH N A, HURBEN A K, CHAO C, et al. Small molecule inhibitors of TET dioxygenases: Bobcat339 activity is mediated by contaminating copper (II)[J]. ACS Medicinal Chemistry Letters, 2022, 13(5): 792-798.
[3] FENG J, SHAO N, SZULWACH K E, et al. Role of Tet1 and 5-hydroxymethylcytosine in cocaine action[J]. Nature Neuroscience, 2015, 18(4): 536-544.
[4] XU Y, YANG Y, WANG Z, et al. ZNF397 deficiency triggers TET2-driven lineage plasticity and AR-targeted therapy resistance in prostate cancer[J]. Cancer Discovery, 2024, 14(8): 1496-1521.
[5] LV H, CATARINO J, LI D, et al. A small-molecule degrader of TET3 as treatment for anorexia nervosa in an animal model[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2023, 120(16): e2300015120.
[6] LUO L, YUAN F, PALOVCAK A, et al. Oncogenic properties of wild-type DNA repair gene FANCA in breast cancer[J]. Cell Reports, 2025, 44(4): 115480.
[7] WANG Y, ZHANG L, LYU T, et al. Association of DNA methylation/demethylation with the functional outcome of stroke in a hyperinflammatory state[J]. Neural Regeneration Research, 2024, 19(10): 2229-2239.
| 細胞実験[1]: | |
細胞株 | HT-22（マウス海馬体ニューロン細胞株） |
準備方法 | 1% DMSOの中の10μM Bobcat 339でHT-22を24時間処理し、溶解した。DNAを抽出し、5hmCのレベルを5hmC特異性の抗体で検出し、全てのシトシン種の5hmCの割合が比色検出で測定されるようにした。 |
反応条件 | 10μM；24時間 |
アプリケーション | Bobcat 339で処理された細胞は、溶媒対照と比べて、全体的な5hmCのレベルを著しく減らし、生細胞でTET酵素機能を阻害することで、DNA 5hmCの量を減らすその能力を示す。 |
| 動物実験 [2]: | |
動物モデル | 一過性中大脳動脈閉塞症（tMCAO）を持ち、リポ多糖類（LPS）誘発（10mg/kg；腹腔内注射）の過剰炎症状態にあるC57BL/6マウス |
準備方法 | Bobcat 339をジメチルスルホキシドに溶解し、1mg/mLの濃度で、生理食塩水で希釈した。手術の3日前に、Bobcat 339 (10mg/kg/日)を尾静脈注射し、その後は手術当日まで、毎日一回注射した。全てのマウスにLPS (10mg/kg)を腹腔内注射し、tMCAOの開始時に、過剰炎症状態を誘発した。再潅流の始まりに、試薬をもう一度投与し、効果を確認した。手術の24時間後に、全てのマウスに行動試験を行った。 |
投与形態 | 10mg/kg/日；3日間；静脈内注射 |
アプリケーション | Bobcat 339 (10mg/kg/日；3日間；静脈内注射)の処理は、tMCAOを持ち、リポ多糖類（LPS）誘発（10mg/kg；腹腔内注射）の過剰炎症状態にあるC57BL/6マウスで、脳梗塞容積を著しく減らし、神経学的と運動学的欠損を改善した。 |
References: | |
| Cas No. | 2280037-51-4 | SDF | |
| 同義語 | BC339 | ||
| Canonical SMILES | O=C1N=C(C(Cl)=CN1C2=CC=CC(C3=CC=CC=C3)=C2)N | ||
| Formula | C16H12ClN3O | M.Wt | 297.7 |
| 溶解度 | DMF: 1 mg/ml,DMSO: 1 mg/ml,DMSO:PBS (pH 7.2) (1:8): 0.11 mg/ml | Storage | Store at -20°C |
| General tips | Please select the appropriate solvent to prepare the stock solution according to the
solubility of the product in different solvents; once the solution is prepared, please store it in
separate packages to avoid product failure caused by repeated freezing and thawing.Storage method
and period of the stock solution: When stored at -80°C, please use it within 6 months; when stored
at -20°C, please use it within 1 month. To increase solubility, heat the tube to 37°C and then oscillate in an ultrasonic bath for some time. |
||
| Shipping Condition | Evaluation sample solution: shipped with blue ice. All other sizes available: with RT, or with Blue Ice upon request. | ||
| Prepare stock solution | |||
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1 mg | 5 mg | 10 mg |
| 1 mM | 3.3591 mL | 16.7954 mL | 33.5909 mL |
| 5 mM | 671.8 μL | 3.3591 mL | 6.7182 mL |
| 10 mM | 335.9 μL | 1.6795 mL | 3.3591 mL |
Step 1: Enter information below (Recommended: An additional animal making an allowance for loss during the experiment)
g
μL
Step 2: Enter the in vivo formulation (This is only the calculator, not formulation. Please contact us first if there is no in vivo formulation at the solubility Section.)
Calculation results:
Working concentration: mg/ml;
Method for preparing DMSO master liquid: mg drug pre-dissolved in μL DMSO ( Master liquid concentration mg/mL, Please contact us first if the concentration exceeds the DMSO solubility of the batch of drug. )
Method for preparing in vivo formulation: Take μL DMSO master liquid, next addμL PEG300, mix and clarify, next addμL Tween 80, mix and clarify, next add μL saline, mix and clarify.
Method for preparing in vivo formulation: Take μL DMSO master liquid, next add μL Corn oil, mix and clarify.
Note: 1. Please make sure the liquid is clear before adding the next solvent.
2. Be sure to add the solvent(s) in order. You must ensure that the solution obtained, in the previous addition, is a clear solution before proceeding to add the next solvent. Physical methods such as vortex, ultrasound or hot water bath can be used to aid dissolving.
3. All of the above co-solvents are available for purchase on the GlpBio website.
Quality Control & SDS
- View current batch:
- Purity: >98.00% Appearance: A solid
- COA (Certificate of Analysis)
- SDS (Safety Data Sheet)
- Datasheet
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