IF 21
PMID: 38671262 ↗Palmitic Acid Alkyne
Catalog No.: GC40292Purity:>99.50%Synonyms: Alk-14
Palmitic Acid Alkyne est un acide palmitique avec une alkyne ω-terminale et un réactif de chimie de Click qui sert d'agent de liaison PROTAC à base de chaîne alkyle avec des molécules contenant des groupes de azide.
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Cas No.: 99208-90-9
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Citations
1 publicationsPublications de chercheurs utilisant ce produitDescription
Palmitic Acid Alkyne est un acide palmitique avec une alkyne ω-terminale et un réactif de chimie de Click qui sert d'agent de liaison PROTAC à base de chaîne alkyle avec des molécules contenant des groupes de azide[1]. Palmitic acid alkyne est utilisé pour la détection des protéines, la liaison conjugative du trafic, les vecteurs d'assistance à l'imagerie et les agents de liaison PROTAC[2,3,4,5].
References:
[1] Honcharenko, Dmytro et al. “New Alkyne and Amine Linkers for Versatile Multiple Conjugation of Oligonucleotides.” *ACS omega* vol. 6,1 579-593. 18 Dec. 2020, doi:10.1021/acsomega.0c05075
[2] Yap, Megan C et al. “Rapid and selective detection of fatty acylated proteins using omega-alkynyl-fatty acids and click chemistry.” *Journal of lipid research* vol. 51,6 (2010): 1566-80. doi:10.1194/jlr.D002790
[3] García-Cazorla, Yolanda et al. “Conjugation inhibitors compete with palmitic acid for binding to the conjugative traffic ATPase TrwD, providing a mechanism to inhibit bacterial conjugation.” *The Journal of biological chemistry* vol. 293,43 (2018): 16923-16930. doi:10.1074/jbc.RA118.004716
[4] Paiva, Eduardo M, and Florian M Schmidt. “Ultrafast Widefield Mid-Infrared Photothermal Heterodyne Imaging.” *Analytical chemistry* vol. 94,41 (2022): 14242-14250. doi:10.1021/acs.analchem.2c02548
[5] Gao, Xinxin, and Rami N Hannoush. “A Decade of Click Chemistry in Protein Palmitoylation: Impact on Discovery and New Biology.” *Cell chemical biology*vol. 25,3 (2018): 236-246. doi:10.1016/j.chembiol.2017.12.002
Protocole (Protocol)
Essai de palmitoykation de Click
1.Ensemencer les cellules HEK293T, et transfecter les cellules avec des plasmides (YKT6-WT BioID, YKT6-3E BioID et Wnt3A) dans DMEM supplémenté avec 10% FBS.
2.Dissoudre ω-Alkynyl palmitic acid (Palmitic Acid Alkyne) dans l'éthanol pour obtenir une concentration finale de 50mM et conserver à -80°C.
3.Diluer Palmitic acid alkyne à la concentration finale de 100µM dans DMEM supplémenté avec 5% FBS (sans acides gras), soniquer pendant 15 minutes à la température ambiante dans un bain d'eau, ensuite, laisser précomplexer pendant 15 minutes supplémentaires.
4.Ajouter du milieu contenant Palmitic acid alkyne et remplacer partiellement après 24 heures.
5.72 heures après la transfection, lyser les cellules (PBS avec 1% Triton x-100, 0.1% SDS, PIC), puis centrifuger à 16000g pendant 5 minutes à 4°C.
6.Précipiter les lysats avec la précipitation de protéines Wessel-Flugge.
7.Dissoudre la réaction de marquage de Click [0.1mM biotin-azide, 1mM Tris(2-carboxyéthyl)phosphine chlorhydrate] dans de l'eau.
8.Incuber avec 0.1mM Tris[(1-benzyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)méthyl]amine dissous dans DMSO et 1mM CuSO4 dans de l'eau en agitant pendant 2 heures à 37°C dans les conditions obscures.
9.Après la réaction de Click, précipiter les échantillons avec 10 x méthanol pendant la nuit à -80°C, puis centrifuger et laver à nouveau avec du méthanol glacé.
10.Resuspendre le culot séché dans SDS à 4%.
11.Précipiter les protéines Click-biotinylées avec de la sérine d'agarose Neutravidin à forte capacité.
12.Laver les échantillons avec SDS à 1% et éluer, puis effectuer une analyse supplémentaire par immunobuvardage.
Ce protocole fournit seulement une ligne directrice, et doit être modifié pour correspondre à vos besoins spécifiques.
References:
1.Linnemannstöns, Karen et al. “Ykt6-dependent endosomal recycling is required for Wnt secretion in the Drosophila wing epithelium.” Development (Cambridge, England) vol. 147,15 dev185421. 14 Aug. 2020, doi:10.1242/dev.185421
Documents produit (Product Documents)
Purity:>99.50%Appearance:A solid
Propriétés chimiques (Chemical Properties)
N° CAS
99208-90-9
Synonymes
Alk-14
Nom chimique
15-hexadecynoic acid
SMILES
C#CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O
Formule moléculaire
C16H28O2
Masse moléculaire
252.4
Solubilité
20mg/mL in DMSO, 30mg/mL in DMF, 30mg/mL in ethanol
Conservation
Store at -20°C
Conseils généraux
Choisissez un solvant adapté selon les données de solubilité du produit. Après préparation, répartissez la solution mère en aliquotes afin d’éviter les cycles répétés de congélation-décongélation.
Utilisez les solutions mères dans les 6 mois si elles sont conservées à -80°C, ou dans le mois si elles sont conservées à -20°C.
Pour améliorer la solubilité, réchauffez le tube à 37°C et soniquez-le pendant une durée appropriée.
Utilisez les solutions mères dans les 6 mois si elles sont conservées à -80°C, ou dans le mois si elles sont conservées à -20°C.
Pour améliorer la solubilité, réchauffez le tube à 37°C et soniquez-le pendant une durée appropriée.
Conditions d’expédition
Les échantillons d’évaluation sont expédiés avec des blocs réfrigérants. Les autres formats sont expédiés à température ambiante ou, sur demande, avec des blocs réfrigérants.
Calculateurs (Calculators)Molarité / Dilution / Masse moléculaire / Conversion d’unités / Formulation in vivo / Solubilité
g/mol
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