DAPI (hydrochloride) (Synonyms: 4',6Diamidino2phenylindole, FxCycle Violet) |
Katalog-Nr.GC43378
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DAPI (hydrochloride) kann als DNA-spezifische Sonde einen fluoreszierenden Komplex bilden, dadurch dass es sich in der kleinen Rille von A-T-reichen DNA-Sequenzen anlagert und nichtfluoreszierende Interkalationskomplexe mit doppelsträngigen Nukleinsäuren bildet.
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Cas No.: 28718-90-3
Sample solution is provided at 25 µL, 10mM.
- Neuropharmacology 297 (2026):111051.PMID:42214456
- Neurotoxicology 88 (2022):134-143.PMID:34785253
- Am j transl res 14.10 (2022):7012.PMID:36398229
- J Virol (2025):e00352-25.PMID:40172227
- Ecotox Environ Safe 213 (2021):112040.PMID:33610943
- J Inorg Biochem 230 (2022):111750.PMID:35151098
- Evid Based Compl Alt (2022).
- Chin J Exp Ophthalmol (2023):127-133.
- bioRxiv (2026):2026-01.
DAPI (hydrochloride) kann als DNA-spezifische Sonde einen fluoreszierenden Komplex bilden, dadurch dass es sich in der kleinen Rille von A-T-reichen DNA-Sequenzen anlagert und nichtfluoreszierende Interkalationskomplexe mit doppelsträngigen Nukleinsäuren bildet. DAPI, ein Chromosomen- und Kernfarbstoff, hat eine maximale Anregungswellenlänge im ultravioletten(UV) Licht von 358 nm und eine Emission im blauen Bereich von 461 nm.[1]
DAPI wird normalerweise für die Durchflusszytometrie, Chromosomenfärbung, DNA-Visualisierung und Quantifuzierung in der Histochemie und Biochemie verwendet.[2] DAPI ist ein gutes Substrat von hOCT1 mit einer Michaelis-Konstante von 8.94 µM.[6]
In vitro kann DAPI(1.43µM) durch Kombination mit Annexin V(FITC) und dem potentiometrischen Fluoreszenzfarbstoff Tetramethylrhodaminmethylester(TMRM) den mitochondrialen Permeabilitätsübergang und die mitochondriale Membrandepolarisation messen.[3] Zur Auswertung der DAPI-Fluoreszenz in vitro wurde SSC-Puffer(pH 7.2) verwendet, der 0.01, 0.015, 0.02, 0.025, 0.03, 0.035, 0.04% SDS oder Triton X-100 und 2 µg/mL DAPI-Farbstoff enthielt. Dabei wurde eine lineare Beziehung zwischen der DAPI-Fluoreszenz und Triton X-100-Konzentrationen im Bereich von 0.01 bis 0.04% festgestellt.[4] Außerdem nahm die Gesamtsignalintensität zu, als die DAPI-Konzentration von 0.4 μM auf 400 μM erhöht wurde. Das deutet auf eine Erhöhung der Konzentration der an die Chromosomen gebundenen DAPI-Moleküle hin.[5] In-vitro-Experimente haben gezeigt, dass die Behandlung mit NR 1 μg/mL, DAPI 5 μg/mL, ORO 0.3% (v/v) und CV 0.5% (v/v) eine optimale Linearität und Signalabdeckung über einen Bereich von Zelldichten(entsprechend 10-100% Zellkonfluenz) lieferte.[7]
References:
[1] Karg TJ, et al. Photoconversion of DAPI and Hoechst dyes to green and red-emitting forms after exposure to UV excitation. Chromosoma. 2018 Jun;127(2):235-245.
[2] Kapuscinski J. DAPI: a DNA-specific fluorescent probe. Biotech Histochem. 1995 Sep;70(5):220-33.
[3] Wallberg F, et al. Analysis of Apoptosis and Necroptosis by Fluorescence-Activated Cell Sorting. Cold Spring Harb Protoc. 2016 Apr 1;2016(4):pdb.prot087387.
[4] Šimoliūnas E, et al. DNA-DAPI Interaction-Based Method for Cell Proliferation Rate Evaluation in 3D Structures. Curr Issues Mol Biol. 2021 May 30;43(1):251-263.
[5] Estandarte AK, et al. The use of DAPI fluorescence lifetime imaging for investigating chromatin condensation in human chromosomes. Sci Rep. 2016 Aug 16;6:31417.
[6] Yasujima T, et al. Characterization of human OCT1-mediated transport of DAPI as a fluorescent probe substrate. J Pharm Sci. 2011 Sep;100(9):4006-12.
[7] Phan MAT, et al. Semi-quantification of lipids in human meibomian gland epithelial cells using dual staining microplate assays. Exp Eye Res. 2021 Sep;210:108719.
Der Plan dient nur als Richtlinie. Bitte passen Sie hin Ihren spezifischen Anforderungen an.
1. Herstellung der Färbelösung
(1) Farbstoff-Stammlösung herstellen: DAPI in ddH2O lösen und eine Stammlösung mit einer Konzentration von 1-10 mg/ml herstellen.
① Das Pulver nicht direkt in Pufferlösung lösen.
② Die vorbereitete Stammlösung muss gefiltert und mit einer 0.22 μm Filtermembran sterilisiert werden.
③ Nicht verwendete Stammlösung sollte entsprechend der Einzeldosis aliquotiert und dunkel bei -20℃ oder -80℃ gelagert werden, um wiederholtes Einfrieren und Auftauen zu vermeiden.
(2) Farbstoff-Arbeitslösung herstellen: Die Stammlösung mit ddH2O der PBS verdünnen und eine Arbeitslösung mit einer Konzentration von 0.5-10μg/ml herstellen.
Hinweis: Bitte passen Sie die Konzentration der Arbeitsflüssigkeit an die jeweilige Situation an und bereiten Sie sie jetzt vor.
2. Färbung der Zellsuspension
(1) Suspensionszellen: 3-5 Minuten bei 4℃(1000 g) zentrifugieren, Überstand verwerfen und zweimal je 5 Minuten mit PBS waschen.
(2) Adhärente Zellen: Zweimal mit PBS waschen, Trypsin hinzufügen, um die Zellen zu verdauen, und nach Abschluss des Verdauungsprozesses 3-5 Minuten bei 1000 g zentrifugieren.
(3) 1 mL DAPI-Arbeitslösung hinzufügen, um die Zellen zu resuspendieren, und 5-30 Minuten bei Raumtemperatur im Dunkeln inkubieren. Die optimale Inkubationszeit ist für verschiedene Zellen unterschiedlich. Prüfen Sie bitte dies entsprechend Ihren experimentellen Anforderungen.
(4) Nach der Inkubation 5 Minuten bei 1000 g zentrifugieren, Überstand entfernen, PBS hinzufügen und 2-3 Mal je 5 Minuten waschen.
(5) Die Zellen in vorgewärmten serumfreiem Zellkulturmedium oder PBS resuspendieren. Mittels Fluoreszenzmikroskopie oder Durchflusszytometrie beobachten.
3. Färbung der Zelladhäsion
(1) Kultivieren Sie adhärente Zellen auf sterilen Deckgläsern.
(2) Entfernen Sie das Deckglas vom Kulturmedium, saugen Sie das überschüssige Kulturmedium ab und legen Sie das Deckglas in eine feuchte Umgebung.
(3) Geben Sie 100 μL Farbstofflösung aus einer Ecke des Deckglas hinzu und schütteln Sie es vorsichtig, um alle Zellen gleichmäßig mit Farbstoff zu bedecken.
(4) Inkubieren Sie das Deckglas 3-5 Minuten bei Raumtemperatur im Dunkeln. Die optimale Inkubationszeit ist für verschiedene Zellen unterschiedlich. Prüfen Sie bitte dies entsprechend Ihren experimentellen Anforderungen.
(5) Nach der Inkubation die Farbstofflösung entsorgen und das Deckglas zwei- bis dreimal mit vorgewärmter Kulturlösung waschen.
4. Mikroskopische Detektion: Das maximale Anregungs-/Emissionslicht von DAPI ist 364 bzw. 454 nm.
Vorsichtsmaßnahmen:
① DAPI eignet sich zum Färben fixierter Zellen oder Gewebe, üblicherweise nach anderen Färbungen.
② Um die Fluoreszenzlöschung zu verlangsamen, kann ein Anti-Fluoreszenzlöscher-Einbettungsmittel verwendet werden.
③ Fluoreszenzfarbstoffe haben alle Probleme mit der Fluoreszenzlöschung. Vermeiden Sie Licht, um die Fluoreszenzlöschung zu verlangsamen.
④ DAPI reizt den menschlichen Körper. Tragen Sie zu Ihrer Sicherheit und Gesundheit beim Arbeiten einen Laborkittel und Einweghandschuhe.
| Cas No. | 28718-90-3 | SDF | |
| Überlieferungen | 4',6Diamidino2phenylindole, FxCycle Violet | ||
| Canonical SMILES | NC(C(C=C1)=CC=C1C2=CC3=CC=C(C(N)=N)C=C3N2)=N.Cl.Cl | ||
| Formula | C16H15N5•2HCl | M.Wt | 350.3 |
| Löslichkeit | Insoluble in EtOH; ≥10 mg/mL in Water; ≥53.3 mg/mL in DMSO | Storage | Store at -20°C, protect from light |
| General tips | Please select the appropriate solvent to prepare the stock solution according to the
solubility of the product in different solvents; once the solution is prepared, please store it in
separate packages to avoid product failure caused by repeated freezing and thawing.Storage method
and period of the stock solution: When stored at -80°C, please use it within 6 months; when stored
at -20°C, please use it within 1 month. To increase solubility, heat the tube to 37°C and then oscillate in an ultrasonic bath for some time. |
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| Shipping Condition | Evaluation sample solution: shipped with blue ice. All other sizes available: with RT, or with Blue Ice upon request. | ||
| Prepare stock solution | |||
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1 mg | 5 mg | 10 mg |
| 1 mM | 2.8547 mL | 14.2735 mL | 28.547 mL |
| 5 mM | 570.9 μL | 2.8547 mL | 5.7094 mL |
| 10 mM | 285.5 μL | 1.4273 mL | 2.8547 mL |
Step 1: Enter information below (Recommended: An additional animal making an allowance for loss during the experiment)
g
μL
Step 2: Enter the in vivo formulation (This is only the calculator, not formulation. Please contact us first if there is no in vivo formulation at the solubility Section.)
Calculation results:
Working concentration: mg/ml;
Method for preparing DMSO master liquid: mg drug pre-dissolved in μL DMSO ( Master liquid concentration mg/mL, Please contact us first if the concentration exceeds the DMSO solubility of the batch of drug. )
Method for preparing in vivo formulation: Take μL DMSO master liquid, next addμL PEG300, mix and clarify, next addμL Tween 80, mix and clarify, next add μL saline, mix and clarify.
Method for preparing in vivo formulation: Take μL DMSO master liquid, next add μL Corn oil, mix and clarify.
Note: 1. Please make sure the liquid is clear before adding the next solvent.
2. Be sure to add the solvent(s) in order. You must ensure that the solution obtained, in the previous addition, is a clear solution before proceeding to add the next solvent. Physical methods such as vortex, ultrasound or hot water bath can be used to aid dissolving.
3. All of the above co-solvents are available for purchase on the GlpBio website.
Quality Control & SDS
- View current batch:
- Purity: >98.00% Appearance: A solid
- COA (Certificate of Analysis)
- SDS (Safety Data Sheet)
- Datasheet
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Related Biological Data
The p62 (sequestosome-1) and LC3-II (microtubule associated protein light chain 3-II) were detected by immunohistochemical and immunofluorescent in myocardia. (A) Expression level of LC3-II was detected by immunohistochemical (scale bar is 50µm).
For nuclear staining, sections were kept in 4, 6-diamido-2-phenylindole dihydrochloride (DAPI) (Glpbio, USA) solution for 15 min.
Ecotox Environ Safe 213 (2021): 112040. PMID: 33610943 IF: 6.294 -
Related Biological Data
KXYApromoted apoptosis of HepAD38 cells. (A)HepAD38 cells was treated with KXYA (500μg/ml) for 48h,there presentative images were DAPI fluorescence, bright and merge images,and statistical analysis ofcell apoptosis count ratio.
HepAD38 cells were stained with 0.1% DAPI(GlpBio,United States) for 10min,washed with PBS.
Frontiers in Pharmacology 13 (2022): 985084. PMID: 36133813 IF: 5.6 -
Related Biological Data
LncRNA OIP5-AS1 interacts with miR-143-3p to regulate the proliferation and apoptosis of HAECs. (C–D) HAECs apoptosis was markedly increased as lnc-OIP5-AS1 was over-expressed, whereas reduced by upregulation of miR-143-3p. Meanwhile, the pro-apoptotic effect of lnc OIP5-AS1 was neutralized by miR-143-3p.
DAPI Detection Kit (GlpBio, USA) was used for TUNEL staining.
Life Sciences (2021): 119199. PMID: 33577845 IF: 5.034 -
Related Biological Data
Distribution of CuInS2/ZnS QDs in U87 cells. (B) Representative confocal images. Left: bright-field; Middle: fluorescent-field; Right: Z-stack image. The scale bar is 10 μm. In the pictures, the blue was the staining of DAPI in the nucleus, and the red was the signal of QDs.
The cells were fixed with preheated 4% paraformaldehyde for 30min and stained with DAPI (Glpbio, USA) solution.
NeuroToxicology (2021). PMID: 34785253 IF: 4.292 -
Related Biological Data
The expression levels of endoplasmic reticulum stress relate genes and proteins in myocardium by excess Cu-induced at days40 and 80. (C) The positive expression levels of GRP78 in myocardium at days40 and 80.
The nuclei were stained with 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) (Glpbio, USA).
J Inorg Biochem (2022): 111750. PMID: 35151098 IF: 4.155 -
Related Biological Data
Tracing of exosomes derived from OS cells. E: PKH26 labeled exosomes were injected into experimental mice by tail vein injection, and then the red fluorescent substances in the OS site were observed under a fluorescence microscope as exosomes.
The cell nuclei were stained with 4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI, 28718-90-3, Glpbio, USA) according to the manufacturer’s protocol.
Am J Transl Res 14.10 (2022): 7012-7026. PMID: 36398229 IF: 3.9398
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